Comment les chercheurs canadiens utilisent-ils le séquençage du génome pour suivre les variantes du virus Corona ?

Toronto - Les chercheurs en maladies infectieuses de l'Université McMaster à Hamilton utilisent le séquençage génomique pour tracer les nouvelles variantes du COVID-19. Il y a maintenant un certain nombre de cas du variant hautement contagieux du coronavirus qui a été découvert pour la première fois au Royaume-Uni en septembre au Canada.

Les chercheurs affirment qu'ils ont pu identifier la nouvelle variante grâce au séquençage génomique, qui fournit des informations génétiques sur l'ADN de l'organisme.

Le Dr Andrew MacArthur, professeur associé et biologiste computationnel en recherche sur les maladies infectieuses à l'Université McMaster, a déclaré dans une interview sur la chaîne CTV canadienne mercredi: "Tout ce qui concerne la biologie du virus est contrôlé par son ADN. Même la manière dont nous vous diagnostiquons lorsque nous effectuons un prélèvement nasal repose sur l'ADN, comme le test de réaction en chaîne par polymérase."

Il a ajouté: "Plus vous étudiez cet ADN, plus vous comprenez sa biologie, comment il infecte les gens et comment il se propage." Il a ajouté: "Tous les agents pathogènes changent au fil du temps et deviennent diversifiés et ont des souches ou des variants, et il faut donc constamment surveiller pour s'assurer qu'aucune de ces variantes n'a de caractéristiques inquiétantes."

Environ 5 % seulement des cas au Canada sont examinés pour des variantes différentes. Étant donné que le suivi du séquençage génomique coûte beaucoup plus cher que le test clinique COVID-19, MacArthur déclare que le Canada ne peut pas isoler chaque cas positif de COVID-19 pour tester la nouvelle variante. C'est pourquoi il propose que les chercheurs travaillent avec des épidémiologistes pour élaborer une stratégie de surveillance solide. Nous savons que ce virus se propage et qu'il est difficile à contenir.

MacArthur déclare: "Il n'y a pas vraiment de surprise quant à sa propagation mondiale." "Cette variante particulière au Royaume-Uni a 23 mutations, un taux bien plus élevé que ce que nous avons l'habitude de voir."

Avec l'approbation et le déploiement mondial des nouveaux vaccins, des questions se posent sur leur efficacité contre différents types de coronavirus. Certains chercheurs se demandent si ces variantes pourraient contourner les vaccins qui ont nécessité des mois et des milliards de dollars pour être développés. "Alors que nous luttons contre cela depuis si longtemps, nous avons les compétences nécessaires pour une évaluation rapide. Cette souche ne semble pas devenir dangereuse, mais les preuves préliminaires indiquent qu'elle est plus contagieuse et qu'il sera difficile de la contrôler," dit MacArthur. "Par conséquent, vous devez vraiment réagir rapidement."

Le 20 décembre, le Canada a annoncé qu'il interdirait temporairement les voyages en provenance du Royaume-Uni pour aider à freiner la propagation de la nouvelle souche. L'interdiction de voyager a ensuite été prolongée jusqu'au moins le 6 janvier 2021.